Apple Watch SE ile Series 9 arasındaki temel farklar şunlardır: Series 9 daha parlak ekran ve gelişmiş tasarım özelliklerine sahiptir. İşlemci olarak S9 çip kullanır ve daha yüksek performans sağlar. Sağlık sensörleri ve algoritmaları gelişmiştir. Batarya ömrü yaklaşık 18 saat olup hızlı şarj özelliği bulunur. Series 9, en yeni watchOS sürümünü çalıştırır ve yeni özellikler içerir. Her iki model de temel akıllı saat fonksiyonlarını yerine getirir ve farklı kullanıcı ihtiyaçlarına cevap verir.